Заповедник «Хакасский» образован 4 сентября на базе государственных природных заповедников «Чазы» и «Малый Абакан».
За 20 лет существования заповедника «Хакасский» его площадь увеличилась более чем в два раза – с 125,5 тысяч гектаров до 267,9 тысячи га. Сегодня здесь трудятся 92 человека.
В 2011 году под управление заповеднику был отдан вновь созданный заказник федерального значения «Позарым» площадью 253, 7 тысяч гектаров. Заказник расположен в горно-таежной части республики и соединяет собой два участка заповедника – «Малый Абакан» и «Заимка Лыковых».
В 2016 году объект «Горный массив «Оглахты» включен в предварительный список Центра Всемирного наследия ЮНЕСКО и признан кандидатом для включения в основной список.
За 20 лет заповедник более десяти раз становился победителем в различных грантовых программах таких организаций как ПРООН ГЭФ, Службы Рыбы и Дичи (США), Всемирного фонда природы, Русского географического общества, РУСАЛа, EN+групп.
В 2010 году заповедник стал участником пилотного проекта Минприроды России по развитию познавательного туризма на особо охраняемых природных территориях. За три последних года поступления от туристской деятельности выросли с 800 тысяч рублей до 5 миллионов рублей в год. Число посетителей увеличилось с 1000 до 12000 человек.
Главным событием этого года станет торжественное открытие многофункционального информационного центра «Позарым». Центр расположен на границе Республики Хакасия и Тыва. Это место визита туристов и отправная точка для путешествия по федеральному заказнику «Позарым», сообщили в пресс-службе заповедника «Хакасский».